Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDCA8Q53HL2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CDCA8Q53HL2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDCA8Q53HL2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms