Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN52Q52LA3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN52Q52LA3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms