Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms