Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIT3Q3SXY7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIT3Q3SXY7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms