Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM12Q3MHD2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms