Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCGF3Q3KNV8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCGF3Q3KNV8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCGF3Q3KNV8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCGF3Q3KNV8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms