Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VMACQ2NL98 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms