Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6LQ2NKX8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms