Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPP1Q16831 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPP1Q16831 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms