Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF239Q16600 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF239Q16600 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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