Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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TAF9Q16594 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF9Q16594 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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TAF9Q16594 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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TAF9Q16594 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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TAF9Q16594 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TAF9Q16594 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF9Q16594 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TAF9Q16594 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TAF9Q16594 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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