Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRADDQ15628 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRADDQ15628 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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