Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCEA2Q15560 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA2Q15560 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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