Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX1Q15475 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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