Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PUM3Q15397 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PUM3Q15397 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
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