Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCAPHQ15003 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCAPHQ15003 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
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