Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHPRHQ149N8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SHPRHQ149N8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHPRHQ149N8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
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