Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIXQ14938 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFIXQ14938 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
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