Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IHHQ14623 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IHHQ14623 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IHHQ14623 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IHHQ14623 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IHHQ14623 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IHHQ14623 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IHHQ14623 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IHHQ14623 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IHHQ14623 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IHHQ14623 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IHHQ14623 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IHHQ14623 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IHHQ14623 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IHHQ14623 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IHHQ14623 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IHHQ14623 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IHHQ14623 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IHHQ14623 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IHHQ14623 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IHHQ14623 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IHHQ14623 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IHHQ14623 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IHHQ14623 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IHHQ14623 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IHHQ14623 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IHHQ14623 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IHHQ14623 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IHHQ14623 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IHHQ14623 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IHHQ14623 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IHHQ14623 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IHHQ14623 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IHHQ14623 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IHHQ14623 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IHHQ14623 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IHHQ14623 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IHHQ14623 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IHHQ14623 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IHHQ14623 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IHHQ14623 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IHHQ14623 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IHHQ14623 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IHHQ14623 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IHHQ14623 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IHHQ14623 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IHHQ14623 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IHHQ14623 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IHHQ14623 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IHHQ14623 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IHHQ14623 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IHHQ14623 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IHHQ14623 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IHHQ14623 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IHHQ14623 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IHHQ14623 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IHHQ14623 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IHHQ14623 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IHHQ14623 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IHHQ14623 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IHHQ14623 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IHHQ14623 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IHHQ14623 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IHHQ14623 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IHHQ14623 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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