Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3AQ14563 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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