Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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