Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB33AQ14088 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB33AQ14088 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB33AQ14088 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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