Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1DQ13901 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1DQ13901 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1DQ13901 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1DQ13901 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1DQ13901 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1DQ13901 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1DQ13901 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1DQ13901 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1DQ13901 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1DQ13901 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1DQ13901 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1DQ13901 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1DQ13901 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1DQ13901 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1DQ13901 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1DQ13901 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1DQ13901 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1DQ13901 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1DQ13901 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1DQ13901 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1DQ13901 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1DQ13901 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1DQ13901 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1DQ13901 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1DQ13901 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1DQ13901 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1DQ13901 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1DQ13901 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1DQ13901 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1DQ13901 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1DQ13901 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1DQ13901 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1DQ13901 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1DQ13901 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1DQ13901 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1DQ13901 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1DQ13901 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1DQ13901 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1DQ13901 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C1DQ13901 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1DQ13901 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1DQ13901 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1DQ13901 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1DQ13901 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1DQ13901 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1DQ13901 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C1DQ13901 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C1DQ13901 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1DQ13901 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1DQ13901 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1DQ13901 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1DQ13901 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1DQ13901 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1DQ13901 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1DQ13901 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1DQ13901 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1DQ13901 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
C1DQ13901 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1DQ13901 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1DQ13901 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1DQ13901 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1DQ13901 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1DQ13901 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1DQ13901 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1DQ13901 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1DQ13901 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1DQ13901 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1DQ13901 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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