Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FHL3Q13643 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FHL3Q13643 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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