Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR4Q13639 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR4Q13639 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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