Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB2Q13425 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms