Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNTA1Q13424 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTA1Q13424 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTA1Q13424 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms