Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA1Q13136 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPFIA1Q13136 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
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