Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RESTQ13127 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RESTQ13127 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RESTQ13127 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RESTQ13127 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RESTQ13127 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RESTQ13127 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RESTQ13127 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RESTQ13127 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RESTQ13127 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RESTQ13127 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RESTQ13127 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RESTQ13127 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RESTQ13127 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RESTQ13127 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RESTQ13127 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RESTQ13127 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RESTQ13127 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RESTQ13127 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RESTQ13127 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RESTQ13127 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RESTQ13127 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RESTQ13127 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RESTQ13127 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RESTQ13127 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RESTQ13127 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RESTQ13127 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RESTQ13127 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RESTQ13127 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RESTQ13127 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RESTQ13127 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RESTQ13127 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RESTQ13127 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RESTQ13127 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RESTQ13127 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RESTQ13127 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RESTQ13127 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RESTQ13127 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RESTQ13127 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RESTQ13127 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RESTQ13127 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RESTQ13127 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RESTQ13127 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RESTQ13127 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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RESTQ13127 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RESTQ13127 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RESTQ13127 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RESTQ13127 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RESTQ13127 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RESTQ13127 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RESTQ13127 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RESTQ13127 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RESTQ13127 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RESTQ13127 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RESTQ13127 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RESTQ13127 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RESTQ13127 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RESTQ13127 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RESTQ13127 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RESTQ13127 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RESTQ13127 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RESTQ13127 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RESTQ13127 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RESTQ13127 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RESTQ13127 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RESTQ13127 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RESTQ13127 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RESTQ13127 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RESTQ13127 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RESTQ13127 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
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RESTQ13127 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
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RESTQ13127 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
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RESTQ13127 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
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RESTQ13127 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RESTQ13127 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RESTQ13127 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RESTQ13127 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RESTQ13127 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RESTQ13127 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RESTQ13127 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RESTQ13127 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RESTQ13127 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RESTQ13127 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RESTQ13127 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RESTQ13127 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RESTQ13127 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RESTQ13127 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RESTQ13127 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RESTQ13127 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RESTQ13127 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RESTQ13127 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RESTQ13127 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RESTQ13127 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RESTQ13127 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RESTQ13127 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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