Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL28Q13084 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL28Q13084 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL28Q13084 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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MRPL28Q13084 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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MRPL28Q13084 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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