Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF1Q13077 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF1Q13077 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
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