Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFIAQ12857 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFIAQ12857 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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