Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YGR139WYGR139W 339 nt6.85□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 BZZ1YHR114W 1902 nt6.85□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 ICL1YER065C 1674 nt6.84□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 MID1YNL291C 1647 nt6.84□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 YDL218WYDL218W 954 nt6.84□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 SCS7YMR272C 1155 nt6.84□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 ENT2YLR206W 1842 nt6.84□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 YDR015CYDR015C 240 nt6.83□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.83□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.83□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.83□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 NPA3YJR072C 1158 nt6.83□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 YKL223WYKL223W 333 nt6.83□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 TSR3YOR006C 942 nt6.83□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 TBF1YPL128C 1689 nt6.83□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 ERG1YGR175C 1491 nt6.82□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 SIP2YGL208W 1248 nt6.82□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.82□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 STM1YLR150W 822 nt6.82□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 CDC1YDR182W 1476 nt6.81□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 HVG1YER039C 750 nt6.81□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 KSS1YGR040W 1107 nt6.81□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 HSP150YJL159W 1242 nt6.81□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 YMR122CYMR122C 375 nt6.81□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 JNM1YMR294W 1122 nt6.81□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 MKK2YPL140C 1521 nt6.81□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 SFB3YHR098C 2790 nt6.8□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 SEC20YDR498C 1152 nt6.8□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 SFC1YJR095W 969 nt6.8□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 YLR317WYLR317W 435 nt6.8□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 CIN4YMR138W 576 nt6.8□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 GFD1YMR255W 567 nt6.8□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 LDB19YOR322C 2457 nt6.8□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 EPS1YIL005W 2106 nt6.8□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 GYP1YOR070C 1914 nt6.8□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 APE3YBR286W 1614 nt6.79□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 TRP3YKL211C 1455 nt6.79□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 VNX1YNL321W 2727 nt6.79□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 AIM20YIL158W 615 nt6.79□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 TDH2YJR009C 999 nt6.79□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.79□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 RBD2YPL246C 789 nt6.79□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 SAC6YDR129C 1929 nt6.79□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 GPA2YER020W 1350 nt6.79□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 YDR109CYDR109C 2148 nt6.78□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 LYS12YIL094C 1116 nt6.78□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 HXT17YNR072W 1695 nt6.77□□□□□ -1.32
LSP1Q12230 QDR3YBR043C 2070 nt6.77□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 MPA43YNL249C 1629 nt6.77□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 YMR295CYMR295C 594 nt6.77□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 RRT2YBR246W 1164 nt6.77□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 GSY2YLR258W 2118 nt6.77□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 SKN1YGR143W 2316 nt6.77□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 QNS1YHR074W 2145 nt6.76□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 TFG2YGR005C 1203 nt6.76□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 MSP1YGR028W 1089 nt6.76□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 SCS22YBL091C-A 528 nt6.76□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 RIM101YHL027W 1878 nt6.76□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 VPS70YJR126C 2436 nt6.76□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 SMF2YHR050W 1650 nt6.75□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 YNL285WYNL285W 372 nt6.75□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 POR1YNL055C 852 nt6.74□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 PSH1YOL054W 1221 nt6.74□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 YPL041CYPL041C 624 nt6.74□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 YML082WYML082W 1950 nt6.73□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 RPS5YJR123W 678 nt6.73□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 RHO2YNL090W 579 nt6.73□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 LSG1YGL099W 1923 nt6.72□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 YER010CYER010C 705 nt6.72□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 YHL018WYHL018W 363 nt6.72□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 SUB2YDL084W 1341 nt6.72□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 YME1YPR024W 2244 nt6.72□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.71□□□□□ -1.33
LSP1Q12230 COX20YDR231C 618 nt6.71□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 YBR124WYBR124W 360 nt6.71□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 VRP1YLR337C 2454 nt6.71□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 CLP1YOR250C 1338 nt6.71□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 ATO3YDR384C 828 nt6.7□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 CSM2YIL132C 642 nt6.7□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 PCS60YBR222C 1632 nt6.69□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 DOT5YIL010W 648 nt6.69□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 SSK1YLR006C 2139 nt6.69□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 DSF1YEL070W 1509 nt6.69□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 YNR073CYNR073C 1509 nt6.69□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 ASH1YKL185W 1767 nt6.69□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 SNZ3YFL059W 897 nt6.68□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 MDH1YKL085W 1005 nt6.68□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 SNZ2YNL333W 897 nt6.68□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 HPF1YOL155C 2904 nt6.68□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 PDR18YNR070W 4002 nt6.68□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 VCX1YDL128W 1236 nt6.67□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 YDL129WYDL129W 876 nt6.67□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 HEM3YDL205C 984 nt6.67□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 LEU5YHR002W 1074 nt6.67□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 MRPL10YNL284C 969 nt6.67□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 UBC11YOR339C 471 nt6.67□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 GEX1YCL073C 1848 nt6.66□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 GEX2YKR106W 1848 nt6.66□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 APS3YJL024C 585 nt6.66□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 YOR111WYOR111W 699 nt6.66□□□□□ -1.34
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