Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SYCNQ0VAF6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms