Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC15Q0P6D6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC15Q0P6D6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms