Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GABPAQ06546 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABPAQ06546 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms