Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITIH3Q06033 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITIH3Q06033 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITIH3Q06033 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITIH3Q06033 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITIH3Q06033 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITIH3Q06033 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms