Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCDQ05655 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms