Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF85Q03923 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF85Q03923 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF85Q03923 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1520.2 ms