Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CAP1Q01518 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CAP1Q01518 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CAP1Q01518 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CAP1Q01518 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAP1Q01518 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAP1Q01518 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CAP1Q01518 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CAP1Q01518 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAP1Q01518 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAP1Q01518 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAP1Q01518 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAP1Q01518 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAP1Q01518 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAP1Q01518 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CAP1Q01518 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAP1Q01518 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CAP1Q01518 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAP1Q01518 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CAP1Q01518 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAP1Q01518 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAP1Q01518 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAP1Q01518 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAP1Q01518 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CAP1Q01518 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAP1Q01518 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAP1Q01518 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAP1Q01518 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms