Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDLBPQ00341 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDLBPQ00341 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms