Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATP2C1P98194 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2C1P98194 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms