Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKOR1P84550 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms