Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT2P78371 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT2P78371 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT2P78371 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT2P78371 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT2P78371 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT2P78371 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT2P78371 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT2P78371 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT2P78371 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT2P78371 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT2P78371 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT2P78371 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT2P78371 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT2P78371 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT2P78371 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT2P78371 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT2P78371 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT2P78371 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCT2P78371 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCT2P78371 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCT2P78371 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCT2P78371 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCT2P78371 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCT2P78371 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCT2P78371 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCT2P78371 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCT2P78371 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCT2P78371 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCT2P78371 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCT2P78371 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCT2P78371 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT2P78371 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCT2P78371 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCT2P78371 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCT2P78371 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCT2P78371 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCT2P78371 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCT2P78371 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT2P78371 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT2P78371 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT2P78371 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT2P78371 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT2P78371 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT2P78371 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT2P78371 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCT2P78371 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCT2P78371 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCT2P78371 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCT2P78371 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCT2P78371 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCT2P78371 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCT2P78371 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCT2P78371 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCT2P78371 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCT2P78371 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCT2P78371 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCT2P78371 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCT2P78371 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCT2P78371 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCT2P78371 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCT2P78371 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCT2P78371 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCT2P78371 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCT2P78371 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCT2P78371 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCT2P78371 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCT2P78371 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCT2P78371 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCT2P78371 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCT2P78371 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT2P78371 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT2P78371 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT2P78371 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT2P78371 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT2P78371 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT2P78371 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCT2P78371 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCT2P78371 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCT2P78371 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCT2P78371 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms