Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM3P62310 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM3P62310 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM3P62310 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM3P62310 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM3P62310 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM3P62310 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM3P62310 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM3P62310 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM3P62310 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM3P62310 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM3P62310 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM3P62310 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM3P62310 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM3P62310 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM3P62310 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM3P62310 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM3P62310 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM3P62310 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM3P62310 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM3P62310 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM3P62310 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM3P62310 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM3P62310 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM3P62310 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM3P62310 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM3P62310 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM3P62310 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM3P62310 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM3P62310 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM3P62310 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM3P62310 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM3P62310 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM3P62310 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM3P62310 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM3P62310 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM3P62310 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM3P62310 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM3P62310 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM3P62310 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM3P62310 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM3P62310 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM3P62310 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM3P62310 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM3P62310 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM3P62310 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM3P62310 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM3P62310 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM3P62310 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM3P62310 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM3P62310 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM3P62310 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM3P62310 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM3P62310 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM3P62310 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM3P62310 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM3P62310 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM3P62310 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM3P62310 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM3P62310 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM3P62310 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM3P62310 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM3P62310 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM3P62310 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM3P62310 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM3P62310 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM3P62310 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LSM3P62310 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM3P62310 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM3P62310 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM3P62310 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM3P62310 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms