Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCS1P62166 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCS1P62166 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NCS1P62166 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCS1P62166 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCS1P62166 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCS1P62166 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCS1P62166 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCS1P62166 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCS1P62166 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCS1P62166 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCS1P62166 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCS1P62166 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NCS1P62166 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCS1P62166 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCS1P62166 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCS1P62166 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCS1P62166 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCS1P62166 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCS1P62166 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCS1P62166 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCS1P62166 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCS1P62166 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCS1P62166 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCS1P62166 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCS1P62166 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCS1P62166 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCS1P62166 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCS1P62166 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCS1P62166 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCS1P62166 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCS1P62166 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCS1P62166 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCS1P62166 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCS1P62166 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCS1P62166 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCS1P62166 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCS1P62166 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCS1P62166 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCS1P62166 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCS1P62166 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCS1P62166 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCS1P62166 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCS1P62166 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCS1P62166 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCS1P62166 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCS1P62166 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NCS1P62166 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCS1P62166 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCS1P62166 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCS1P62166 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCS1P62166 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCS1P62166 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCS1P62166 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCS1P62166 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCS1P62166 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCS1P62166 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCS1P62166 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCS1P62166 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCS1P62166 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCS1P62166 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCS1P62166 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
NCS1P62166 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCS1P62166 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCS1P62166 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCS1P62166 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCS1P62166 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCS1P62166 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCS1P62166 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCS1P62166 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCS1P62166 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCS1P62166 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCS1P62166 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCS1P62166 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCS1P62166 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCS1P62166 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCS1P62166 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 322.3 ms