Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BP1P59074 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BP1P59074 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms