Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX8P57073 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX8P57073 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX8P57073 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX8P57073 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX8P57073 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX8P57073 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX8P57073 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX8P57073 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX8P57073 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX8P57073 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX8P57073 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX8P57073 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX8P57073 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX8P57073 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX8P57073 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX8P57073 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX8P57073 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX8P57073 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX8P57073 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX8P57073 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX8P57073 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX8P57073 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX8P57073 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX8P57073 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX8P57073 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX8P57073 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX8P57073 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX8P57073 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX8P57073 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX8P57073 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX8P57073 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX8P57073 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX8P57073 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX8P57073 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX8P57073 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX8P57073 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX8P57073 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX8P57073 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX8P57073 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX8P57073 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX8P57073 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX8P57073 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX8P57073 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX8P57073 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX8P57073 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX8P57073 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX8P57073 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOX8P57073 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX8P57073 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOX8P57073 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX8P57073 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX8P57073 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX8P57073 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX8P57073 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX8P57073 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX8P57073 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX8P57073 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX8P57073 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX8P57073 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX8P57073 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX8P57073 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX8P57073 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX8P57073 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX8P57073 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX8P57073 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX8P57073 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX8P57073 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX8P57073 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX8P57073 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX8P57073 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX8P57073 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX8P57073 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms