Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME5P56597 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME5P56597 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME5P56597 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME5P56597 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME5P56597 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME5P56597 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME5P56597 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME5P56597 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME5P56597 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME5P56597 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME5P56597 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME5P56597 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME5P56597 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NME5P56597 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME5P56597 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME5P56597 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME5P56597 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME5P56597 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NME5P56597 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME5P56597 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME5P56597 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME5P56597 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME5P56597 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME5P56597 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME5P56597 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME5P56597 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME5P56597 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME5P56597 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME5P56597 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME5P56597 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME5P56597 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME5P56597 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME5P56597 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME5P56597 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME5P56597 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME5P56597 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME5P56597 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME5P56597 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NME5P56597 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NME5P56597 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME5P56597 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME5P56597 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms