Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA1P56199 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms